كشفت رواية الخفاش أقسام مخابرات الجماعه التي تشمل قسم الوزرات، وقسم الجامعات والمعاهد، وقسم الأحزاب، وقسم النقابات، وقسم البرلمان، وقسم الأزهر والأوقاف، وقسم الكنيسة، وقسم الأعلام، وقسم رجال الأعمال وقسم الأتصال الدولي، وقسم التيارات الإسلامية، وقسم الامن، وقسم العمليات.

ورصدت الرواية أن كل قسم له رئيس يقوم بالأشراف علي أعماله ويعاونه وكيل يقوم بالأتصال ومتابعة مسئول علي عمل المكاتب الإقليمية التى تضم أربع قطاعات وهي قطاع الصعيد و قطاع غرب الدلتا وقطاع شرق الدلتا، وقطاع سيناء ومدن القناة، وكل قطاع يشرف على عمل عدد المحافظات التى تقع فى نطاقه، وبالنسبة لمكتب المحافظة يشرف على المدن الموجودة، ومكاتب المدن تشرف على القري التابعة لهم، ولا تترك الجماعه النجوع والكفور، وبالنسبة لمدن الحضر يتم تقسيمها إلى أحياء، ومكاتب المحافظات بها الثلاث عشر تخصص ويعمل بها عناصر إخوانية شديدة التدريب.

وتحكي رواية الخفاش عن أوراق سرية للسيد عمرو تفضح جرائم الإخوان في 25 يناير، وأسرار تكشف للمرة الأولي في قالب درامي، وخطوات الإخوان من أجل الوصول إلي الحكم بمساعدة المخابرات الأمريكية والانجليزية.